动物种质资源库隶属于中国科学院昆明动物研究所，是法人实体单位中国科学院昆明动物研究所的独立部分。2009年正式加入我国生命科学领域首个重大科技基础设施——中国西南野生生物种质资源库运行，以采集、保藏、管理我国及周边地区重要动物种质资源为主要职责，服务于动物科学研究和生物产业发展。
        动物种质资源库重点采集保藏我国及周边地区野生动物、家养动物、野生近缘种。历经20余年积累，动物种质资源库现冷冻保存保藏畜禽品种200余个，地方种群290余个，野生脊椎动物3000余物种，共计20万份，保藏规模位居国际前列。脊椎动物馆藏规模居国际前列，其中哺乳类、两栖类、爬行类馆藏资源形成体系。
        动物种质资源库保藏区占地150平米，并配套建有完整的分子生物学、细胞学实验平台。近年建成一个200万份存储量超低温样本库（单台冰箱库）， 100万份存储量超低温自动化样本库，10万份存储量深低温样本库，总存储量达300万份。根据动物资源特点结合丰富经验自主设计开发“动物种质资源信息管理系统1个，实现资源信息在线检索、入库-质检-审核-出库-反馈等工作流线上操作与闭环管理。根据生物样本库国家标准（GBT 37864-2019 生物样本库质量和能力通用要求）和动物样本库国际标准（ISO 20388 动物生物样本保藏要求）并结合自身经验编写《动物种质资源库质量管理体系》1套并投入使用。至此基本实现资源库自动化、信息化、标准化管理。